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制藥廠分為生物制藥和化學制藥。制藥廢水的處理方法可歸納為以下幾種：物化處理、化學處理、生化處理以及多種方法的組合處理等，各類處理方法具有各自的優勢及不足。生物制藥工業是以糧食為原料，發酵培養特定藥用微生物，發酵液經過壓濾后濾液可用化學手段提取。在制藥過程中主要有兩類廢水：發酵廢水和提取廢水。發酵廢水中混有發酵殘渣和微生物菌等，懸浮物含量高，對某些微生物有較強的抑制作用。可以采用生化處理的方法，加入混凝劑可使懸浮物沉淀下來，清液對微生物的抑制性明顯降低。提取廢水是濾清液用化學方法提出藥性成分后的廢水。
處理制藥廢水過程中要用到絮凝劑的情況一般如果是生化污泥處理的話一般選擇離子度較高的陽離子聚丙烯酰胺產品，在機濃度很高的情況下，選擇離子度60以上的效果佳，在電解處理或者是前段氣浮處理情況下，要根據污水的水質，關鍵的技術指標是看PH值大小來判斷絮凝劑的選擇情況，一般原則的PH小于7的話常選用非離子聚丙烯酰胺做助凝劑或者是污泥濃縮沉淀劑。如果是PH是7以上，常用的是陰離子聚丙烯酰胺。浮渣達到一定厚度時，由氣浮罐頂部的刮泥機刮入泥渣池，大顆粒污泥沉如錐體，由排泥閥排入污泥池，污泥進一步濃縮后經添加高分子絮凝劑絮凝，脫水設備脫水，泥餅填埋或外運。
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由于藥的種類和成分有區別，導致制藥污水水質不同，需要選用不同型號的聚丙烯酰胺產品型號。聯晟環保建議在制藥廢水選用水處理絮凝劑時，先在實驗室進行小試，再到工廠進行大師，以此確定選用型號。
